數字病理掃描設備硬件是通過軟件控制系統控制掃描相機通過光學顯微鏡系統將病理切片掃描成數字圖像，在掃描過程中使用馬達平臺移動載玻片平臺配合掃描相機將切片進行線性或者面性掃描。無論是線性還是面性掃描都需要事先對切片圖形對焦，類似于相機拍攝照片對焦，線性掃描是將每條線設置焦點（面掃描時每個掃描面設置焦點）按照焦點需找相機對應的切片位置進行掃描。

掃描的同時，計算機通過信號傳輸接受圖像，每掃描一條線或一個面，計算接就接受該部分，待全部掃描完成后，將整個切片的所有線或面利用圖像拼接系統拼接成為一個整合的圖像，拼接的精度和準確度非常關鍵，如果拼接不，拼接邊緣就會出現縫隙，影響讀片效果。

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